Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gcm2O09102 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gcm2O09102 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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