Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms