Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms