Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4340L7N2C4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms