Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms