Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm4791J3QQ14 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms