Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms