Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm20877J3QPZ4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms