Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21900J3QP38 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21900J3QP38 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21900J3QP38 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms