Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim22J3QP37 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms