Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim18J3QNP2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms