Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem200cJ3QK46 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms