Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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