Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20696H3BJN7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms