Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sclt1G5E861 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms