Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M1F7CXU4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms