Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms