Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myo5cE9Q1F5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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