Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ddx60E9PZQ1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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