Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsf1E9PWW9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms