Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc8E9PWG2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms