Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde2E9PUP1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms