Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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