Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms