Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms