Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms