Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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