Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms