Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf1bp1B2KF50 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms