Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms