Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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