Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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