Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms