Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GabreA2AMW3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GabreA2AMW3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms