Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmpd1A2AKB4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms