Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms