Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2dnl1A2AFH1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms