Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms