Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms