Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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