Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3Q9Z2D8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms