Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms