Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms