Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms