Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms