Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms