Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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