Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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