Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdcQ9QW08 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms