Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rabgef1Q9JM13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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